Trabalhar com imagens linkadas tem uma série de vantagens: imagina uma campanha que tenha umas 15 peças (cartaz, panfleto, anúncio de jornal, anúncio de revista, etc...), nas peças tem uma imagem que se repete, só que em tamanhos e locais diferentes, se você estiver usando a imagem linkada e por acaso o cliente quiser uma modificação nela, você apenas abre a imagem, faz a modificação e pronto, em todas as outras peças, ao abrir o arquivo, o link vai ser atualizado. Se você estiver com a imagem embutida (embeded) você terá que abrir os arquivos, re-importar a imagem e reposicioná-la uma por uma.
Agora tem um porém: nas imagens linkadas o illustrator não conserva o blend mode das layers do photoshop.
Ex.: Se você tem uma foto com uma sombra em multiply, quando linkar a imagem, o multiply vai pro espaço. Aí você teria de embutir mesmo a imagem.
Para contornar isso, desenvolvi uma "gambiarra", você cria uma arquivo de illustrator no mesmo tamanho da tua imagem, embute ela nesse arquivo, salva e usa esse .ai para linkar nas outras peças. Se o cliente quiser mudar a foto, você muda o .psd, coloca novamente no arquivo base (.ai) que você criou (embutida) e pronto, todas as peças estarão com a modificação quando você atualizar o link.